加強農業面源污染綜合防治
從農業面源污染防治和生態農業視角出發，開展農業綠色發展行動，通過提高農藥和化肥的利用率，將農業面源污染減少到最低限度。推進有機復合肥料和生物肥料替代化肥、農作物秸稈綜合利用、農膜及農藥包裝廢棄物回收處理、病蟲害綠色防控。大力發展生態農業、節水型農業，在農村裝備高科技節水技術，全面改進地面灌溉技術，減少農藥、化肥污染。
加大農村控源截污和生態修復力度
在全面推行河長制的基礎上，落實鄉鎮、村級的河長和湖長責任制，塌陷區水域和洼地參照湖長制。嚴查農村生活垃圾亂堆亂倒、河湖違法養殖、工業企業廢水和居民生活污水直排入河，從源頭減少污染物排放。開展農村水生態修復，保護和恢復鄉村河湖、濕地生態系統，連通河湖水系，恢復河塘行蓄能力，推進退田還湖還濕、退圩退垸還湖。采取控源截污、清淤疏浚、生態修復等工程措施整治農村黑臭水體，推進農村生態清潔小流域建設。
增強農村居民的環保意識
在農村地區普及環境保護知識，特別是通過中小學教育增加學生和家長的環保意識。同時，利用手機推送環境保護常識，通過電視、廣播及網絡媒介向農村居民宣傳水環境污染的嚴重危害性及保護環境的重要性，使農村居民增強保護生產生活環境的意識。
